Южно-Сахалинск — крупный экономический центр России. В Южно-Сахалинске находится штаб-квартира ПАО «Сахалинэнерго» — крупнейшей энергокомпании на востоке России, также в городе расположены офисы компаний «Эксон Нефтегаз Лимитед»,  «Сахалин Энерджи», «Газпром», «Роснефть» (ООО «РН-Сахалинморнефтегаз») — операторов и подрядчиков проектов «Сахалин-1» и «Сахалин-2», крупнейших нефтегазовых проектов  Дальнего Востока. Основой пищевой промышленности является производство рыбной продукции, в том числе консервированной. В 2017 году на территории города было зарегистрировано 78 рыбодобывающих компаний, было добыто 340 тыс. тонн рыбы и морепродуктов. В городе находятся более 90 торговых и развлекательных центров. ТРК «СитиМолл» — один из самых крупных на Дальнем Востоке торгово-развлекательный комплекс, общая площадь ТРК — 64 000 м.